發明
中華民國
093113884
I 293686
SARST-蛋白質結構快速搜尋比對工具
國立清華大學
2008/02/21
本發明提供一種蛋白質結構比對之方法,其包括下述步驟: (1)由該蛋白質之結構座標,計算出該蛋白質所含各胺基酸的雙面角角度值(dihedral angles)(Φ,ψ),此步驟將蛋白質結構3D訊息轉換為2D訊息; (2)將該等雙面角角度值轉換成拉馬詮德朗氏碼(ramachandran code)序列,其中各碼代表拉馬詮德朗氏 圖(ramachandran plot)上一特定之分區,亦即將蛋白質結構2D訊息轉換為1D訊息;利用序列比對工具,比對不同蛋白質之拉馬詮德朗氏碼序列,進而找出相似之蛋白質結構。
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