以代謝物標誌為基礎之預測乳癌復發風險的方法

專利類型

發明

專利國別 (專利申請國家)

中華民國

專利申請案號

108131541

專利證號

I 716093

專利獲證名稱

以代謝物標誌為基礎之預測乳癌復發風險的方法

專利所屬機關 (申請機關)

高雄醫學大學

獲證日期

2021/01/11

技術說明

背景：雙酚A是目前普遍已知環境賀爾蒙之一，目前有越多證據顯示暴露雙酚A會增加乳房細胞的發育毒性，本研究以乳癌病人生物晶片資料，與暴露於雙酚A乳房上皮細胞株(MCF 10F)之生物晶片進行交集分析其調節路徑和候選基因，功能性基因分析則利用BRB-ArrayTools軟體，Ingenuity Pathway Analysis (IPA)軟體，Biocarta pathways軟體，找出與乳癌易感性的相關基因。。 結果：以雙酚A暴露於MCF 10F細胞株，並進一步與乳癌組織之生物晶片(為GPL570平台)資料進行交集比對，基因表現量皆達顯著差異者，得到60個共同表現之嶄新候選基因，並利用敏感度、特異度以及接收操作特徵曲線(Receiver Operator Characteristic curve, ROC curve) 之曲線下面積(Area Under Curve, AUC) 來評估準確率。進一步再以不同生物晶片平台(GPL571或GPL96)之乳癌晶片進行驗證，挑選出6個最具顯著性之基因分別為FN1、TXNIP、TGFBR3、ADCK3、FHL1、CD36，以及其最具意義之排列組合，包括最佳兩個基因FN1, TXNIP組合，最佳三個基因FN1, TXNIP, TGFBR3的組合，最佳4個基因FN1, TXNIP, TGFBR3, ADCK3的組合，任五個基因組合及六個最佳基因的排列組合，AUC皆達98.3%~100.0%有極佳之檢測正確性。可作為檢測環境荷爾蒙影響乳癌異感性之相關基因或基因套組。 結論：本研究顯示乳癌與環境荷爾蒙相關之基因路徑有高度顯著相關，以測試模式及驗證模式之基因組，皆顯示可有效評估受測檢體是否為環境荷爾蒙誘發之乳癌。 We compared commonly expressed genes from microarray data of BPA-treated MCF10F cells, stroma cells and breast cancer tissue. Functional gene sets analyses were performed in BRB-Array Tools software, Ingenuity Pathway Analysis (IPA) and Biocarta pathways. The study is to explore that BPA-regulated pathways and candidate genes would be associated with breast cancer susceptibility. Results: The 60 novel genes were significant identified in BPA-exposed cell line and breast cancer datasets. These candidate genes were further validated with different platform (GPL571 or GPL96) microarray data. The top 6 of the most significant expressed genes (FN1、TXNIP、TGFBR3、ADCK3、FHL1、CD36) were selected to assess the accuracy of prediction. The area under the ROC curve analysis, sensitivity and specificity were used to judge the accuracy of default probability models which is BPA-regulated genes or gene group in susceptibility of breast cancer.

備註

連絡單位 (專責單位/部門名稱)

智財保護與科技管理組

連絡電話

07-3138030

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