基於全體基因表現及生物反應路徑以及基因本體學之反應路徑分群方法

專利類型

發明

專利國別 (專利申請國家)

中華民國

專利申請案號

101118539

專利證號

I 468968

專利獲證名稱

基於全體基因表現及生物反應路徑以及基因本體學之反應路徑分群方法

專利所屬機關 (申請機關)

國立中正大學

獲證日期

2015/01/11

技術說明

各種基因晶片或基因定序技術的發展，產生了大量基因表現實驗數據，由於資料數量龐大難以人工分析，本方法利用基因實驗中所產生的基因表現量數據和生物反應路徑資料庫建構生物反應路徑交互作用網路，並利用拓樸網路分析方法，將彼此間高度密切交互作用的反應路徑群聚成具單一生理功能之反應路徑群組，再搭配基因本體學的功能化分析，以簡潔的生物辭彙精確地描述每一反應路徑群組的生物功能，最後解析出導致實驗過程變化之分子機制。 This invention is to develop a machine-implemented method for analyzing genome-wide gene expression profilings based on biological pathway and gene ontology (GO). First, the method weights each gene with its respective expression abundance change to evaluate and select the pathways that are most affected by transcriptional changes in genome-wide expression experiments. Second, based on a novel graph theory, the activated pathways (e.g. p<0.05) highly connected through heavily interacting gene partners can be clustered into different biologically meaningful modules to form a pathway network that may uncover the global organization of all the pathway topology. Finally, the annotated biological information of each pathway cluster could be determined using a GO clustering method same as that used for the pathway network, which can be used to identify the relevant biological modules for deciphering the molecular mechanisms behind a given biological/disease status such as cancer.

備註

本會(收文號1120061952)同意該校112年9月20日中正研發字第1120900742號函申請終止維護專利

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